Die Schule wird durch ihre inklusive reformpädagogische Ausrichtung geprägt. Von der 5. bis zur 13. Klasse lernen die Schülerinnen und Schüler gemeinsam. Sowohl das individuelle wie auch das soziale Lernen gehören zum Schwerpunkt der Schule. Im engen Zusammenhang steht die Förderung der Sebstständigkeit und der Eigenverantwortung. Weiterhin legt die Ganztagsschule einen Fokus auf die berufliche Orientierung. Die Kinder sollen sich ihrer Interessen, Stärken und Begabungen bewusst werden.
Drei Jahre mussten Lehrer, Eltern und Schülerder Neuen Schule Magdeburg kämpfen,um zum Start des Schuljahres 2015/2016 offiziell als staatlich anerkannte Ersatzschule zu gelten. Die Schule orientiert sich an Grundsätzen der Reformpädagogik - d.h. es wird mit Kopf, Herz und Hand sowie allen Sinnen selbstständig und eigenverantwortlich gelernt. Die Selbsttätigkeit der Schüler ist der Ausgangspunkt allen Lernens und das Erlernen dieser Selbständigkeit demzufolge eines der wichtigsten Ziele der Schule.
Die Lehrenden verstehen sich dabei als Partner und Unterstützer. Was genau hinter dem Konzept der inklusiven, reformpädagogischen Gemeinschaftsschule steckt, ist unter www.ottokar.info unter dem Titel „Du bist, was du lernst“ nachzulesen.